公募研究

増田G 
ロングリードメタゲノムによる植物共生微生物叢のポストコッホ解析

研究の概要

植物と共生する微生物は宿主の生育に重要であるにも関わらず、その種類や機能の多くは未解明である。また、共生微生物の多くは、宿主存在下で集団を形成し叢として機能している。そのため、単一菌のみならず叢としての役割を理解する必要がある。本研究では、最先端技術であるロングリードシークエンサーを用いたメタゲノム解析を行い、植物共生微生物叢の全体像を明らかにする。ロングリードシークエンサーでのメタゲノム解析法を開発し、長らく不明であった植物共生微生物叢の種の構成、プラスミド群、および遺伝子群を明らかにする。

研究チーム

研究代表者

増田幸子 (理化学研究所)

研究協力者

白須賢 (理化学研究所)
柴田ありさ (理化学研究所)