これまでに膨大な微生物ゲノムや環境メタゲノムがシーケンスされてきた一方で、それらゲノムデータに含まれる遺伝子の大多数は機能未知であり、その機能を理解するための情報科学的手法開発は喫緊の研究課題である。遺伝子は多くの場合他の遺伝子と協調して機能を発揮することから、サンプル間で共起する遺伝子は機能が類似していると考えられ、この考えに基づく機能推定手法は系統プロファイル法と呼ばれる。しかし既存の系統プロファイル法は、偽陽性や擬似相関を多く検出しやすいという問題点があった。本研究では、逆イジングモデル法と呼ばれるアルゴリズムを利用することで、系統プロファイル法による機能未知遺伝子の機能推定を高精度に行うソフトウェアの開発を目的とする。この方法ではサンプルを出力する生成モデルを考え、全ての遺伝子を同一の生成モデルの下で取り扱う事によって擬似相関や偽陽性を取り除く。