研究成果

研究成果2019年度

Research articles/Reviews

2019年度

A01班

Mitsuru Yasuda, Norio Takeshita, and Shinsuke Shigeto, Inhomogeneous Molecular Distributions and Cytochrome Types and Redox States in Fungal Cells Revealed by Raman Hyperspectral Imaging Using Multivariate Curve Resolution?Alternating Least Squares, Analytical Chemistry, 91, -, 12501-12508, 2019.10, doi: 10.1021/acs.analchem.9b03261

Ami Matsuda, Naoko Sakaguchi, and Shinsuke Shigeto, Can cells maintain their bioactivity in ionic liquids? A novel single‐cell assessment by Raman microspectroscopy, Journal of Raman Spectroscopy, 50, -, 768-777, 2019.06, doi: 10.1002/jrs.5579

Kyota Mitsuyama, Takeaki Tezuka, Yasuo Ohnishi, Identification and Characterization of a Cell Wall Hydrolase for Sporangiospore Maturation in Actinoplanes missouriensis, Journal of Bacteriology, , -, 0-0, 2019.09, doi: 10.1128/JB.00519-19, in press

 

A02班

Vejarano F, Suzuki-Minakuchi C, Ohtsubo Y, Tsuda M, Okada K, Nojiri H., Complete genome sequence of Thalassococcus sp. strain S3, a marine Roseobacter clade member capable of degrading carbazole, Microbiology Resource Announcements, 8, -, e00231-19, 2019.07, doi: 10.1128/MRA.00231-19

Motomu Matsui and Wataru Iwasaki, Graph Splitting: A Graph-Based Approach for Superfamily-Scale Phylogenetic Tree Reconstruction, Systematic Biology, , -, 0-0, 2019.08, doi: 10.1093/sysbio/syz049, Published online

Shingo Kato, Miho Hirai, Moriya Ohkuma, Katsuhiko Suzuki, Microbial metabolisms in an abyssal ferromanganese crust from the Takuyo-Daigo Seamount as revealed by metagenomics,PLoS ONE, 14, 11, e0224888, 2019.11, doi: 10.1371/journal.pone.0224888

Shingo Kato, Takashi Itoh, Masahiro Yuki, Mai Nagamori, Masafumi Ohnishi, Katsuyuki Uematsu, Katsuhiko Suzuki, Tomonori Takashina, Moriya Ohkuma, Isolation and characterization of a thermophilic sulfur- and iron-reducing thaumarchaeote from a terrestrial acidic hot spring, The ISME Journal, 13, 10, 2465-2474, 2019.10, doi: 10.1038/s41396-019-0447-3

Nattakorn Kuncharoen, Takuji Kudo, Masahiro Yuki, Moriya Ohkuma, Pattama Pittayakhajonwut, Somboon Tanasupawat, Micromonospora radicis sp. nov., isolated from roots of Azadirachta indica var. siamensis Valenton, and reclassification of Jishengella zingiberis as Micromonospora zingiberis comb. nov., International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 69, 9 , 2884-2891, 2019.09, doi: 10.1099/ijsem.0.003574

Sineenath Kunthiphun, Thippawan Wattanagonniyom, Rikiya Endoh, Masako Takashima, Moriya Ohkuma, Somboon Tanasupawat, Ancharida Savarajara, Heterocephalacria mucosa sp. nov., a new basidiomycetous yeast species isolated from a mangrove forest in Thailand, International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 69, 9, 2823-2827, 2019.09, doi: 10.1099/ijsem.0.003562

Akira S. Hirao, Ryosuke Imai, Rikiya Endoh, Moriya Ohkuma, Yousuke Degawa, Draft Genome Sequence of Novel Metschnikowia sp. Strain JCM 33374, a Nectar Yeast Isolated from a Bumblebee, Microbiology Resource Announcements, 8, 37, e00704-19, 2019.09, doi: 10.1128/MRA.00704-19

Shingo Kato, Shinsaku Nakano, Mariko Kouduka, Miho Hirai, Katsuhiko Suzuki, Takashi Itoh, Moriya Ohkuma, Yohey Suzuki, Metabolic Potential of As-yet-uncultured Archaeal Lineages of Candidatus Hydrothermarchaeota Thriving in Deep-sea Metal Sulfide Deposits, Microbes and Environments, 34, 3, 293-303, 2019.09, doi: 10.1264/jsme2.ME19021

International meetings/Invited talks

Invited talks

A01班

重藤真介, ポストコッホ時代の微生物を観る、採る, 新学術領域「ポストコッホ生態」キックオフシンポジウム, 20190926, 国内会議, 筑波

重藤真介, ラマンデータ解析と微生物研究への展開, 第13回バイオ関連化学シンポジウム, 20190905, 国内会議, 仙台

重藤真介, 微生物のラマン分光で見えるもの:細胞内代謝物から細胞外微粒子まで, 微生物ウィーク, 20190727, 国内会議, 東京

Shinsuke Shigeto and Shogo Toda, Infrared electroabsorption spectroscopy of nanoconfined water, 10th International Conference on Advanced Vibrational Spectroscopy, 20190712, 国際会議, Auckland, New Zealand

Masanori Toyofuku, How do bacteria “really” communicate?, Marine Biotechnology Conference 2019, 20190709-13, 国際会議, 静岡

豊福雅典, 細菌の生き様を捉える, 生化学若い研究者の会, 20191109, 国内会議, 新潟

野村暢彦, 生体内小分子はどのように細胞間を移動しているのだろうか?~微生物間コミュニケーションの新たな展開~, 微生物ウィーク2019, 20190701, 国内会議, 東京

豊福雅典, 細菌のメンブレンベシクル形成機構と機能, 第10回愛媛微生物学ネットワーク(NAME), 20191019, 国内会議, 愛媛

豊福雅典, ベシクルを介した細菌の化学コミュニケーション, 第14回化学生態研究会, 20190628-29, 国内会議, 北海道

中井亮佑, 稀少微生物たちの実態と新機能を探る, 第14回 札幌微生物勉強会, 20190906, 国内会議, 札幌

玉木秀幸, 未知の微生物を”培養”して新たな生物機能を探る, BioJapan2019 バイオインダストリー大賞・奨励賞受賞講演会, 20191009, 国内会議, 横浜

 

A02班

新谷政己, プラスミドによる複合微生物系の制御を目指して ~複合微生物系におけるプラスミドの動態~ , 第71回日本生物工学会大会, 20190917, 国内会議, 岡山

新谷政己, 環境中を真に伝播しているプラスミドの同定とその伝播経路の解明に向けて, 2019年度(令和元年度)国立遺伝学研究所 研究会, 20190820, 国内会議, 国立遺伝学研究所講堂,静岡

新谷政己, 環境中の微生物群集内における プラスミド伝播の実態の解明に向けて, 微生物ウイーク2019 企画シンポジウム, 20190726, 国内会議 , 東京

野尻秀昭, 接合伝達性プラスミドの二面性~遺伝情報の保存装置と進化駆動装置~, 2019年度(令和元年度)国立遺伝学研究所 研究会, 20190819, 国内会議, 国立遺伝学研究所講堂,静岡

高谷直樹, ポストコッホ生態が目指すところ, 新学術領域「ポストコッホ生態」キックオフシンポジウム, 20190926, 国内会議, 筑波

松井求、岩崎渉, グラフに基づく新たな系統解析手法で隠れた遠距離進化を発掘する, 日本進化学会第21回大会, 2019.08.08, 国内会議 , 札幌

松井求, 微生物情報が描く生態系への挑戦, 新学術領域「ポストコッホ生態」キックオフシンポジウム, 20190926, 国内会議, 筑波

雪 真弘、大熊 盛也, 難培養微生物のシングルセルゲノム解析, 第52回日本原生生物学会大会, 20191027, 国内会議, 水戸

雪 真弘、大熊 盛也, シロアリ腸内原生生物と細胞内・表面共生細菌間の相互作用, 日本微生物生態学会第33回大会, 20190913, 国内会議, 甲府

加藤 真悟、小笠原 綾香、伊藤 隆、 酒井 博之、 雪 真弘、高品 知典、大熊 盛也, 好熱好酸性ナノアーキアの共培養系から探るアーキア間相互作用, 日本微生物生態学会第33回大会, 20190913, 国内会議, 甲府

加藤真悟, 深海底の熱水性硫化鉱物を「食べる」化学合成生態系, 日本地球化学会第66回年会, 20190919, 国内会議, 東京

 

International meetings

A01班

Tsung-Han Liu, Ken-ichi Yuyama, Takato Hiramatsu, Naoki Yamamoto, Eri Chatani, Hiroshi Miyasaka, Teruki Sugiyama, and Hiroshi Masuhara, Promotion of amyloid fibrillation by femtosecond laser irradiation, The 29th International Conference on Photochemistry, 20190725, Colorado, USA

 

A02班

Hibiki Kawano, Tomomi Ueda, Chiho Suzuki-Minakuchi, Kazunori Okada, Hideaki Nojiri, Pseudomonas resinovorans CA10dm4 shows the novel trait “plasmid-insensitivity”, ASM Microbe 2019, 20190623, San Francisco, USA

Moriya Ohkuma, Recent Activities of RIKEN BRC-JCM, Asian Network of Research Resource Centers, the 11th International Meeting, 20191017, Laguna, Philippines

Shingo Kato, Takashi Itoh, Masahiro Yuki, Masafumi Ohnishi, Nagamori Mai, Tomonori Takashina, Moriya Ohkuma, Isolation of a Sulfur- and Iron-reducing Thermoacidophilic Thaumarchaeote, 15th International Congress on Thermophiles, 20190905, Fukuoka, Japan

Hiroyuki D. Sakai, Naswandi Nur, Antonius Suwanto, Takashi Itoh, Moriya Ohkuma, Norio Kurosawa, Experimental Evidence of Symbiotic Lifestyle of a Thermophilic ARMAN Related Archaeon (‘Candidatus Micrarchaeota’) on Various Sulfolobales species, 15th International Congress on Thermophiles, 20190905, Fukuoka, Japan

Takashi Itoh, Shigo Kato, Moriya Ohkuma, Japan Collection of Microorganisms Is Homes to a Diverse Groups of Thermophilic Archaea and Bacteria, 15th International Congress on Thermophiles, 20190905, Fukuoka, Japan

Awards

2019年度

A01班

Shun Kobayashi, Daisuke Hira, Keitaro Yoshida, Masanori Toyofuku, Yosuke Shida, Wataru Ogasawara, Takashi Yamaguchi, Nobuo Araki, Mamoru Oshiki, Nitric Oxide Production from Nitrite Reduction and Hydroxylamine Oxidation by Copper-containing Dissimilatory Nitrite Reductase (NirK) from the Aerobic Ammonia-oxidizing Archaeon, Nitrososphaera viennensis, 2018年度 M&E論文賞, 2019年09月, 日本微生物生態学会, 日本

山本達也、野村暢彦、豊福雅典, 細菌が放出するベシクルの新奇形成機構の発見, 第18回オレオサイエンス賞, 2019年09月, 日本油化学会, 日本

玉木秀幸, 未知の微生物を”培養”して新たな生物機能を探る, 第3回バイオインダストリー奨励賞, 2019年10月, 一般財団法人バイオインダストリー協会, 日本

手塚武揚, 胞子嚢を形成する希少放線菌の形態分化に関する分子遺伝学的研究, 浜田賞(研究奨励賞), 2019年09月, 日本放線菌学会, 日本

A02班

TBA

Outreach activity/Others

2019年度

A01班

跡見晴幸, 極限環境下の生命:微生物とその多様性, The Extremes of Life: Microbes and Their Diversity, 20191001開講-20200805終了, 英語, edX 主催, ネット配信

跡見晴幸, 新学術領域「超地球生命体を解き明かすポストコッホ機能生態学」, 第20回極限環境生物学会年会, 2019年11月16-17日, 日本語, 極限環境生物学会 主催, 京都大学桂キャンパス

重藤真介, ポストコッホ微生物学のすすめ, 20191024, 日本語, 関西学院高等部 主催, 西宮

大西康夫, 醗酵学研究室 研究紹介, 醗酵学研究室 研究室見学及び模擬授業(大阪府立天王寺高校), 20190803, 日本語, 東京

大西康夫, 醗酵学研究室 研究紹介, 醗酵学研究室 研究室見学及び模擬授業(静岡県立藤枝東高校), 20190803, 日本語, 東京

大西康夫, 醗酵学研究室 研究紹介, 醗酵学研究室 研究室見学及び研究解説(神奈川県立湘南高校), 20190809, 日本語, 東京

大西康夫, 醗酵学研究室 研究紹介, 醗酵学研究室 研究室見学及び研究解説(私立フェリス女学院高校), 20190809, 日本語, 東京

 

A02班

新谷政己, 環境は持続可能か? ~微生物による環境浄化の開発~ ,  創立70周年記念 静岡大学・読売新聞連続市民講座 2019 令和を生きる~新時代への展望~ , 20190907, 日本語, 静岡大学・読売新聞連続市民講座, 静岡 あざれあ大ホール, 市民講座

野尻秀昭, 環境の微生物研究への招待, 20190806, 日本語, 東京大学生物生産工学研究センター, 東京, 高校生向けの模擬講義

野尻秀昭, 環境の微生物科学への誘い, 20190710, 日本語, 東京大学生物生産工学研究センター, 東京, 高校生向けの模擬講義

野尻秀昭, 大学の教員は何をする職業なのか?, 富山県立富山高等学校第1学年進路講演会, 20190704, 日本語, 富山県立富山高等学校, 富山, 高校生向けの模擬講義進路講演会で研究を紹介

森ヶ崎進, 新学術領域「ポストコッホ生態」の紹介, 令和元年度(2019年度)遺伝研研究会「微生物における大規模ゲノム・代謝改変技術とその利用」, 20191122, 日本語, 国立遺伝学研究所, 静岡, ライトニングトークで領域研究を紹介